Русская версия English version   
Том 19   Выпуск 2   Год 2024
Обнаружение потенциальных терапевтических целей при рецидиве рака молочной железы: дифференциально экспрессируемые гены у пациентов после операции

Хамад Али Хамад1, Хаммад Халаф Саид2, Талиб Хаммад Хусейн2, Абдалвахаб Бдеви Хусейн1, Нур Фариша Мд Хашим3

1Колледж прикладных наук, Университет Фаллуджи, Фаллуджа, Анбар, Ирак
2Госпиталь Рамади, Управление здравоохранения Аль-Анбара, Министерство здравоохранения, Анбар, Ирак
3Факультет медицины и медицинских наук, Университет Путра Малайзия, Серданг, Малайзия

Аннотация. Сообщалось, что различные внутренние и внешние факторы, включая генетические изменения и факторы окружающей среды, способствуют рецидиву опухоли. Однако информации о значительно нарушенной регуляции генов и путей, ответственных за рецидив рака,  после хирургического удаления опухолей и химиотерапии до сих пор мало. Целью данного исследования является выявление основных генов, связанных с прогрессированием рака, которые могут играть решающую роль в рецидиве рака молочной железы. Нами был использован набор данных микрочипов платформы Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array для выявления генов с пониженной и повышенной экспрессией, которые связаны с рецидивом опухоли у пациентов после операции. Исследование включает 20 образцов, 10 образцов, извлеченных во время диагностики, и 10 образцов, взятых через 30 минут после операции и химиотерапии. Гены, которые выделяются среди остальных по уровню экспрессии, были дополнительно подвергнуты последующему анализу функционального обогащения и идентификации генов-концентраторов для точного определения ключевых генов, связанных с рецидивом. Результаты показали, что сверхэкспрессированные гены обнаруживаются в сигнальных путях, связанных с прогрессированием рака, например, в пути Wnt и в протеогликанах. Более того, выявленные ключевые гены-концентраторы (COL1A1, IGF1, COL1A2, DCN, LUM, MMP2, JUN, CXCL12, THBS2 и LOX) в основном играют роль в регуляции экспрессии генов, нарушении регуляции иммунной системы, эпителиально-мезенхимальном переходе и ремоделировании внеклеточного матрикса, тем самым способствуя развитию рака и увеличивая вероятность рецидива после операции и химиотерапии. Результаты выявили ключевые терапевтические мишени, связанные с рецидивом опухоли через потенциальные гены, связанные с ВКМ, чья сверхэкспрессия может значительно способствовать онкогенезу у выживших после рака молочной железы путем эпителиально-мезенхимального перехода, и нацеливание на них может повысить шансы на лучшую выживаемость пациентов с раком молочной железы и повысить качество жизни за счет снижения вероятности рецидива. Однако исследование основано исключительно на биоинформатике; поэтому будущие исследования будут экспериментально подтверждаться для выявления этих ключевых генов в качестве потенциальных терапевтических мишеней.


Ключевые слова: рак молочной железы, набор данных микрочипов, сверхэкспрессированные гены, гены, связанные с внеклеточным матриксом,  связанные с прогрессированием рака сигнальные пути, путь Wnt.

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2024;19(2):276-292
doi: 10.17537/2024.19.276
опубликована на англ. яз.

Аннотация (англ.)
Аннотация (рус.)
Полный текст (англ., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2024