Русская версия English version   
Том 19   Выпуск 2   Год 2024
Моделирование структуры белка tRolC Nicotiana tabacum и его функциональная связь с другими белками

Цветкова А.Д.1, Швец Д.Ю.2,3, Мусин Х.Г.2, Кулуев Б.Р.1,2

1Уфимский университет науки и технологий, Уфа, Россия
2Институт биохимии и генетики – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра, Уфа, Россия
3Башкирский государственный медицинский университет, Уфа, Россия

Аннотация. Ген trolC является гомологом онкогена rolC Agrobacterium rhizogenes и попал в геном Nicotiana tabacum, вероятнее всего, в результате горизонтального переноса генов. Этот ген довольно консервативен, экспрессируется в молодых органах, однако его функции, как и агробактериального гена rolC, остаются неизвестными. В настоящей работе проанализирована предположительная структура белка tRolC Nicotiana tabacum, предсказанная с помощью сервиса I-TASSER. Наличие у белка tRolC аминокислотных остатков активного центра и сайта связывания, а также белок-связывающей и ARTT-петли, сходных по структуре с белком 6b Agrobacterium vitis, свидетельствует о выполнении ими сходных биологических функций. На основе полученных данных высказана гипотеза о наличии у белка tRolC АДФ-рибозилтрансферазной активности, позволяющей ему влиять на рост и устойчивость растений к стрессам, а также на биосинтез вторичных метаболитов посредством влияния на регуляцию экспрессии генов через взаимодействие с факторами транскрипции, компонентами РНК-интерференции или проявление гистоноподобной активности.


 

Ключевые слова: Agrobacterium rhizogenes, rol-гены, rolC, белок 6b, АДФ-рибозилтрансферазы, компьютерное моделирование.

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2024;19(2):322-337
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2024