Факультет вычислительной математики и кибернетики, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Москва, 119991, Россия
НТЦ Биоклиникум, Москва, 115088, Россия

Аннотация. Рассматривается нелинейная модель данных ДНК-микрочипов, в которой интенсивность флуоресценции проб описывается функцией Лэнгмюра. Разработан метод настройки параметров модели на основе общедоступных данных нескольких тысяч экспериментов, основанный на минимизации функции потерь из класса AB-дивергенций; для выбора оптимальных значений гиперпараметров проведены численные эксперименты. Полученная модель описывает интенсивности флуоресценции проб микрочипа точнее стандартной линейной, а полученные на её основе оценки экспрессии более устойчивы.

Ключевые слова: ДНК-микрочипы, суммаризация, модель Лэнгмюра, AB-дивергенция.