Институт биофизики клетки, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия 
Пущинский государственный естественно-научный институт, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Нижегородский государственный университет, биологический факультет, Нижний Новгород, 603950, Россия
Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация. Функциональные свойства промоторных островков генома кишечной палочки, т.е. участков с аномально высокой плотностью сигналов транскрипции, сопоставлены со свойствами геномных областей, аномально обогащённых А/Т-парами. Установлено, что компьютерные выборки участков обоих типов по соответствующим критериям частично перекрываются, а их функциональные свойства во многом похожи. Однако промоторные островки отличаются от АТ-богатых последовательностей большей способностью к синтезу коротких олигонуклеотидов, которые могут быть целевыми продуктами этих необычных участков или побочными продуктами их супрессированного состояния. В островках чаще, чем в АТ-богатых участках и намного чаще, чем в местах расположения обычных промоторов встречаются инвертированные повторы. Так как структурные элементы такого типа обычно являются мишенями для взаимодействия с димерами и тетрамерами регуляторных белков, можно предположить, что инициация транскрипции с островковых промоторов контролируется регуляторными сетями клеток и, следовательно, их короткие РНК-продукты могут быть нужны для нормальной жизнедеятельности бактерий. Об этом, в частности, свидетельствует высокое содержание в клетках кишечной палочки олигонуклеотида, синтез которого с островкового промотора гена yjgL подтвержден экспериментально. 

Ключевые слова: промоторные островки, АТ-богатые участки генома, абортивный синтез, нетранслируемые РНК, горизонтальный перенос генов.