Русская версия English version   
Том 2   Выпуск 1   Год 2007
Стехиометрический анализ биохимических систем на графах. II. Графовые образы балансных соотношений

Ермаков Г.Л.

Институт теоретической и экспериментальной биофизики, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация. Рассмотрено применение графических правил нахождения балансных соотношений (линейных интегралов движения), кинетических уравнений биохимических систем. На простых примерах гипотетических реакций показано, что представление сложной реакции/метаболической сети в виде связного ориентированного двудольного графа и использование его свойств позволяет выявлять вещества, связанные балансными соотношениями, и сформулировать графовые критерии их существования. Показано, что графовыми образами балансных соотношений в графе открытой биохимической системы являются подграфы в виде либо простых и/или сложных циклов, либо в виде совокупности простых и/или сложных циклов и соединяющих их мостов.

Ключевые слова: графы, стехиометрический анализ, балансные соотношения.


 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2007;2(1):48-59
doi: 10.17537/2007.2.48
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2024