Русская версия English version   
Том 10   Выпуск 2   Год 2015
Идентификация новых потенциальных ингибиторов белка gp41 ВИЧ-1 методами виртуального скрининга и молекулярного моделирования

Кашин И.А., Тузиков А.В., Андрианов А.М.

Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь
Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь

Аннотация. Проведен виртуальный скрининг химических соединений, способных имитировать фармакофорные свойства моноклонального антитела 10Е8, проявляющего нейтрализующую активность против широкого набора вариантов ВИЧ-1. Методами докинга и молекулярной динамики выполнена оценка эффективности связывания найденных соединений с участком MPER (Membrane-Proximal External Region) белка gp41 ВИЧ-1, ответственным за слияние мембран вируса и клетки-мишени. Обнаружены восемь химических соединений, характеризующихся отрицательными значениями свободной энергии образования структурных комплексов с этим функционально важным участком ВИЧ. Полученные данные свидетельствуют о перспективности использования идентифицированных соединений в работах по созданию новых противовирусных препаратов – ингибиторов слияния ВИЧ, блокирующих участок MPER белка gp41. 

Ключевые слова: ВИЧ-1, белок gp41, моноклональное антитело 10Е8, пептидомиметики, виртуальный скрининг, молекулярное моделирование, ингибиторы слияния ВИЧ.

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2015;10(2):325-343
doi: 10.17537/2015.10.325
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2024