Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов
Тюлько Ж.С., Кутыркин В.А., Чалей М.Б.
ОмГМУ Минздрава России, Омск, Россия
МГТУ им. Н.Э. Баумана, Москва, Россия
ИМПБ РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Московская область, Россия
Аннотация. На основе спектрально-статистического подхода исследуются основные структурно-статистические свойства кодирующих районов из геномов флавивирусов. Анализируются как полноразмерные кодирующие районы полипротеинов, так и их отдельные структурные сегменты. Показано, что структурно-статистические свойства геномных последовательностей флавивирусов, в целом, аналогичны выявленным ранее свойствам 3-регулярности и скрытой триплетной профильности в кодирующих районах геномов прокариот и эукариот. С другой стороны, в отдельных, кодирующих белки, структурных сегментах из геномов флавивирусов полностью отсутствует двухуровневая организация кодирования, и в их значительной части проявляется свойство однородности последовательности. Такие особенности кодирующих районов флавивирусов объясняются простой структурой и высокой скоростью мутаций их геномов.
Ключевые слова: геном флавивирусов, геном прокариот, геном эукариот, спектрально-статистический подход, скрытая профильная периодичность, свойство 3-регулярности.