Русская версия English version   
Том 12   Выпуск 2   Год 2017
Численный бифуркационный анализ математических моделей с запаздыванием по времени с использованием пакета программ DDE-BIFTOOL

Лузянина Т., Зибер Я., Энгелборгхс К., Самаи Д., Розе Д.

Институт математических проблем биологии РАН – филиал Института прикладной математики им. Келдыша, Пущино, Россия 
Факультет математики, Университет Эксетера, Эксетер, Англия
Материализе NV, Левен, Бельгия
Факультет прикладной математики, Католический Университет Левена, Хеверли-Левен, Бельгия
 
Аннотация. Математическое моделирование с помощью дифференциальных уравнений с запаздыванием по времени широко используется для анализа и предсказания в различных областях биологической науки, например, в популяционной динамике, эпидемиологии, иммунологии, физиологии, нейронных сетях. Запаздывание по времени в этих моделях учитывает зависимость текущего состояния моделируемой системы от ее поведения в прошлом. Запаздывание может участвовать в описании продолжительности определенных скрытых процессов, как, например, периоды жизненного цикла, время между инфекцией клетки и появлением новых вирусов, продолжительность инфекционного периода, иммунного периода и т.д. По причине бесконечномерной природы дифференциальных уравнений с запаздыванием по времени аналитическое изучение соответствующих математических моделей может дать только ограниченные результаты. Поэтому численный анализ является основным способом достижения качественного и количественного понимания динамики моделей. Бифуркационный анализ динамической системы используется для понимания зависимости поведения решения системы и его устойчивости от изменения параметров системы. Пакет программ DDE-BIFTOOL является первым универсальным пакетом для бифуркационного анализа дифференциальных уравнений с запаздыванием. Этот пакет может быть использован для вычисления и анализа локальной устойчивости стационарных и периодических решений данной системы, для изучения зависимости этих решений от параметров системы методом продолжения по параметру. Также, с помощью этого пакета можно вычислять и продолжать по параметру несколько локальных и глобальных бифуркаций, как то: седло-узловая бифуркация и бифуркация Хопфа для стационарных решений; седло-узловая бифуркация, удвоение периода и бифуркации торов для периодических решений; гомоклинические и гетероклинические решения. В этой статье мы описываем структуру пакета DDE-BIFTOOL, используемые в пакете численные методы и иллюстрируем использование пакета для определенной системы дифференциальных уравнений с запаздыванием по времени
 
Ключевые слова: нелинейная динамика; дифференциальные уравнения с запаздыванием; анализ устойчивости; периодические решения; метод коллокаций; численный бифуркационный анализ; запаздывание, зависящее от решения системы.

 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2017;12(2):496-520
doi: 10.17537/2017.12.496
опубликована на англ. яз.

Аннотация (англ.)
Аннотация (рус.)
Полный текст (англ., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2024