¹Институт иммунологии и физиологии УрО РАН, Екатеринбург, Россия
²Уральский федеральный университет, Екатеринбург, Россия

Аннотация. RBCK1 дефицит - редкое врожденное наследственное заболевание аутовоспалительной природы, которое вызывает нарушение воспалительных процессов на молекулярном уровне. Данное заболевание имеет три основных клинических проявления: повышенную чувствительность к бактериальным инфекциям, синдром аутовоспаления и накопление амилопектина в скелетных мышцах. Амилопектиноз вызывает миопатию и кардиомиопатию. Патогенез заболевания мало изучен и может включать незамеченные взаимосвязи. В данной работе был проведен анализ дифференциальной экспрессии генов у пациентов с RBCK1 дефицитом и тремя другими аутовоспалительными заболеваниями. Идентификация дифференциально экспрессированных генов выявила большое число генов с пониженной экспрессией, которые вовлечены в активацию ключевых метаболических и имунных путей, включающих Nf-kb и Pi3k-Akt-mTOR. Сигнальные пути были проанализированы с использованием KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) и ресурса Gene Ontology. Предсказанные белок-белковые взаимодействия были получены из STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting proteins database). Помимо первичного вовлечения в патологию RBCK1 дефицита, некоторые пути пониженной регуляции усиливают симптомы миопатии, кардиомиопатии и бактериальных заболеваний. Изученные сигнальные пути могут служить новыми мишенями в разработке компенсаторной терапии для пациентов с RBCK1 дефицитом.

Ключевые слова: профилирование генетической экспрессии, аутовоспалительные заболевания, RBCK1, сигнальные пути, белок-белковые взаимодействия.