Институт математических проблем биологии РАН - филиал Института прикладной математики им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Московская область, Россия

Аннотация. Исследована модицифированная модель первичной фотореакции в родопсине – цис-транс фотоизомеризации хромофора (ретиналя). Квантовая подсистема модели включает три вибронных состояния: основное состояние, возбуждённое состояние и основное состояние первичного фотопродукта. Данным состояниям соответствуют три точечные массы в классической подсистеме. Модификация заключается в экспоненциальной зависимости электронно-колебательной константы связи от смещения точечных масс. Исследованы свойства оптимальных локусов многопараметрического пространства, для которых характерно наилучшее согласие с экспериментальными данными. Показан достаточно малый «многомерный объём» данных локусов во всех диапазонах используемых значений параметров модели. Предложен ряд путей оптимизации квантово-классической модели фотоизомеризации родопсина. 

Ключевые слова: родопсин, хромофор, ретиналь, хромофор, цис-транс фотоизомеризация, поверхность потенциальной энергии, квантово-классическая модель.