Русская версия English version   
Том 3   Выпуск 2   Год 2008
Связь формы белка со скоростью его сворачивания и разворачивания

Богатырева Н.С., Иванков Д.Н., Лобанов М.Ю., Галзитская О.В.

Институт белка, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация. Проблема самоорганизации белковых глобул является на сегодняшний день одной из важных проблем молекулярной биологии. Несмотря на успех последних лет в понимании общих закономерностей процесса сворачивания, детали этого процесса до конца не ясны. Поэтому поиск факторов, влияющих на кинетику сворачивания, продолжается по сей день. В этой работе мы проверяем предположение о том, что более округлые белки сворачиваются медленнее вытянутых белков. С этой целью мы анализируем ряд структурных параметров, предназначенных для описания формы белка, и их связь со скоростью сворачивания и разворачивания. Мы показываем, что безразмерные структурные параметры, описывающие форму белка, плохо коррелируют со скоростями сворачивания и разворачивания белков. В то же время структурные параметры, учитывающие и форму, и размер белка, дают хорошее согласие с экспериментально наблюдаемыми скоростями сворачивания и разворачивания белка.


Ключевые слова: компактность, радиус инерции, радиус поперечного сечения, простой механизм сворачивания «все или ничего», сложный механизм сворачивания с накоплением промежуточного состояния.


 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2008;3(2):69-78
doi: 10.17537/2008.3.69
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2021