Русская версия English version   
Том 15   Выпуск 2   Год 2020
Путь реакции высвобождения продукта при детоксикации NO на активном центре усеченного гемоглобина N в теории многоконфигурационного самосогласованного поля

Симон К.В., Тулуб А.В.

Санкт-Петербургский государственный университет. Россия
 
Аннотация. Теория мультиконфигурационного самосогласованного поля (МКССП) с оптимизацией геометрии была применена для расчета электронных свойств активного центра гемового ядра усеченного гемоглобина N, в который включена функциональная группа [ONOO] и две молекулы воды. В качестве стартовых были взяты локализованные молекулярные орбитали. Для построения МКССП функций были использованы два подпространства полного взаимодействия. Первое из них включает 3d функции атома железа, второе – связанные и разрыхляющие орбитали пероксинитрита вместе подобными орбиталями O2-фрагмента. Реакция характеризуется двумя переходными состояниями, ее продуктами является нитратный анион [NO3]- вместе с одной несвязанной молекулой воды. Показано, что существует вероятность образования в качестве продуктов радикалов NO2 и NO.
 
Ключевые слова: бацилла туберкулеза, структура активного центра гема, пероксинитритная структура, неэмпирический МКССП расчет, переходные состояния, O2/NO химия.
Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2020;15(2):172-179
doi: 10.17537/2020.15.172
опубликована на англ. яз.

Аннотация (англ.)
Аннотация (рус.)
Полный текст (англ., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2022