Русская версия English version   
Том 18   Выпуск 1   Год 2023
Применение технологий виртуального скрининга и молекулярного моделирования для идентификации потенциальных ингибиторов основной протеазы коронавируса SARS-CoV-2

Андрианов А.М.1, Фурс К.В.2, Гончар А.В.2, Асланян Л.А.3, Тузиков А.В.2

1Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь
2Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь
3Институт проблем информатики и автоматизации Национальной академии наук Республики Армения, Ереван, Армения

Аннотация. Проведен виртуальный скрининг молекулярной библиотеки биологически активных соединений, направленный на идентификацию потенциальных ингибиторов основной протеазы (Mpro) SARS-CoV-2, играющей важную роль в процессе репликации вируса. Методами молекулярного докинга и молекулярной динамики выполнена оценка энергии связывания этих соединений с каталитическим сайтом фермента, в результате которой идентифицированы шесть молекул, проявляющих высокое химическое сродство к Mpro SARS-CoV-2. Об этом свидетельствуют низкие значения свободной энергии образования комплексов лиганд/Mpro, сопоставимые с величинами, предсказанными для мощного нековалентного ингибитора Mpro SARS-CoV-2 с использованием идентичного вычислительного протокола. На основе полученных данных сделан вывод о том, что найденные соединения обладают хорошим терапевтическим потенциалом для ингибирования каталитической активности фермента и формируют перспективные базовые структуры для разработки новых эффективных препаратов против COVID-19.


Ключевые слова: SARS-CoV-2, основная протеаза, виртуальный скрининг, молекулярный докинг, молекулярная динамика, противовирусные препараты.

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2023;18(1):15-32
doi: 10.17537/2023.18.15
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-