¹Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь
²Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь
³Институт проблем информатики и автоматизации Национальной академии наук Республики Армения, Ереван, Армения

Аннотация. Проведен виртуальный скрининг молекулярной библиотеки биологически активных соединений, направленный на идентификацию потенциальных ингибиторов основной протеазы (Mpro) SARS-CoV-2, играющей важную роль в процессе репликации вируса. Методами молекулярного докинга и молекулярной динамики выполнена оценка энергии связывания этих соединений с каталитическим сайтом фермента, в результате которой идентифицированы шесть молекул, проявляющих высокое химическое сродство к Mpro SARS-CoV-2. Об этом свидетельствуют низкие значения свободной энергии образования комплексов лиганд/Mpro, сопоставимые с величинами, предсказанными для мощного нековалентного ингибитора Mpro SARS-CoV-2 с использованием идентичного вычислительного протокола. На основе полученных данных сделан вывод о том, что найденные соединения обладают хорошим терапевтическим потенциалом для ингибирования каталитической активности фермента и формируют перспективные базовые структуры для разработки новых эффективных препаратов против COVID-19.

Ключевые слова: SARS-CoV-2, основная протеаза, виртуальный скрининг, молекулярный докинг, молекулярная динамика, противовирусные препараты.