Динамика переноса заряда в упорядоченных и неупорядоченных нуклеотидных последовательностях
Н.С. Фиалко, В.Д. Лахно
Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, Россия
Аннотация. Исследуется перенос заряда в системах, состоящих из донора, акцептора и мостиковых сайтов – (АТ)-нуклеотидных пар. Для мостика из 180 (АТ)-пар рассматриваются три случая: однородный, когда все нуклеотиды в каждой нити ДНК одинаковы; регулярный, когда через равное число (АТ)-пар встречаются (ТА)-пары, и нерегулярный – когда мостик состоит из случайно разбросанных (АТ)- и (ТА)-пар. Показано, что во всех случаях есть перенос с донора на акцептор. При одинаковых условиях перенос наиболее эффективен в случае однородного полинуклеотида, затем по убыванию – для регулярной и неупорядоченной цепочки. Результаты расчетов согласуются с экспериментальными данными по переносу заряда в ДНК на большие расстояния.
Ключевые слова: ДНК, акцептор, донор, дырка, моделирование, уравнение Шредингера.