Русская версия English version   
Том 16   Выпуск 2   Год 2021
Дизайн и идентификация потенциальных ингибиторов проникновения ВИЧ-1 методами in silico клик-химии и молекулярного моделирования

Андрианов А.М.1, Юшкевич А.М.2, Босько И.П.2, Карпенко А.Д.2, Корноушенко Ю.В.1, Фурс К.В.2, Тузиков А.В.2

1Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, 220141 Минск, Республика Беларусь
2Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, 220012 Минск, Республика Беларусь

Аннотация. С помощью комплексного подхода, включающего методологию клик-химии, молекулярный докинг, квантовую механику и молекулярную динамику, осуществлен компьютерный дизайн потенциальных ингибиторов ВИЧ-1, способных блокировать мембрано-проксимальную внешнюю область белка gp41, играющую важную роль в процессе слияния мембран вируса и клетки хозяина. Методами молекулярного моделирования выполнена оценка эффективности связывания сконструированных соединений с пептидом MPER ВИЧ-1, в результате которой идентифицированы девять химических соединений, характеризующихся высокой аффинностью связывания с этим функционально важным участком оболочки вируса. Полученные данные свидетельствуют о перспективности использования этих соединений в работах по созданию новых противовирусных препаратов – ингибиторов слияния ВИЧ, блокирующих ранние стадии развития ВИЧ инфекции.

Ключевые слова: ВИЧ-1, белок gp41, мембрано-проксимальная внешняя область, ингибиторы слияния ВИЧ, клик-химия, молекулярное моделирование, противовирусные препараты.

 
Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2021;16(2):317-334
doi: 10.17537/2021.16.317
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2022