Русская версия English version   
Том 18   Выпуск 1   Год 2023
In-silico исследование роли регуляции экспрессии генов ABC-транспортеров с помощью OncomiRs (miR-21, miR-15 и miR-let-7) в предотвращении химиорезистентности при раке молочной железы

Бан Х. Халаф1, Ахмед А. Сулейман2, Мохаммед А. Сувейд3

1Фармацевтический колледж Анбарского университета, Рамади, Анбар, Ирак
2Кафедра биотехнологии, Научный колледж, Университет Анбар-Рамади, Анбар, Ирак
3Отделение медицинской онкологии, Онкологический центр Анбара, Анбар, Ирак

Аннотация. Рак молочной железы является наиболее распространенным и агрессивным злокачественным новообразованием у женщин, в мире насчитывается 77.9 миллионов больных этим видом рака. Для лечения инвазивных и злокачественных опухолей используются химиотерапия и лечение ингибиторами тирозинкиназы; однако инвазивные опухоли показали устойчивость к традиционным методам лечения. АТФ-связывающие кассетные транспортные белки (ABC транспортеры) играют решающую роль в развитии рака молочной железы из-за их химиорезистентности и способности выводить лекарства. Кроме того, сообщалось о химиорезистентной роли ряда белков из семейства ABC транспортеров при некоторых видах рака, таких как рак шейки матки, рак толстой кишки, плоскоклеточный рак пищевода, глиома и ГЦК. Цель  исследования состояла в том, чтобы определить супрессорную роль трех микроРНК (miR-21, miR-15, miR-let-7) в генах химиорезистентных белков, а именно ABCA1, ABCB1 и ABCC1, при раке молочной железы. Программные средства TargetScan, miRWalk и miRDB использовались для прогнозирования взаимодействий микроРНК-мРНК. MC-Sym и RNAComposer использовались для предсказания третичных структур микроРНК и мРНК. Для молекулярного докинга и визуализации использовались HDOCK и PyMOL. Настоящее исследование выявило 10, 7 и 13 взаимодействий между микроРНК (miR-21, miR-15 и miR-let-7) и онкогенами (ABCA1, ABCB1, ABCC1) с помощью программ miRWalk, miRDB и TargetScan соответственно. РНК22 предсказала сайты связывания микроРНК (22-х miR-21, 11-ти miR-15 и 58-ми miR-let-7) с ABCA1, ABCB1 и ABCC1 соответственно. Для трех лучших комплексов были построены 3D-визуализации на основе максимальной оценки достоверности и наименьшей аффинности связывания. Настоящее исследование идентифицирует взаимодействия двух новых (miR-15a-5p и let-7c-5p) микроРНК с генами ABCA1, ABCB1 и ABCC1, демонстрируя характеристики  эффективного связывания. Результаты этого исследования могут помочь в разработке препаратов на основе микроРНК, которые будут воздействовать на белки трансмембранного транспорта из семейства ABC, в частности ABCA1, ABCB1 и ABCC1, для ингибирования усиленного оттока лекарств, создавая условия для повышенной химиорезистентности при раке молочной железы.


Ключевые слова: ABC-транспортеры, микроРНК, miR-21, miR-15, miR-let-7, рак молочной железы.

 
Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2023;18(1):128-144
doi: 10.17537/2023.18.128
опубликована на англ. яз.

Аннотация (англ.)
Аннотация (рус.)
Полный текст (англ., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-