Русская версия English version   
Том 9   Выпуск 2   Год 2014
Предсказание генов маркеров агрессивности глиомы низкой степени злокачественности по экспрессионным данным TCGA

Иванисенко Н.В., Губанова Н.В., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.

Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск, Россия
Новосибирский государственный университет, Новосибирск, Россия

ivanisenko@bionet.nsc.ru

Аннотация. Глиома низкой степени злокачественности (ГНСЗ) представляет собой группу опухолей ЦНС. В отличие от других злокачественных субтипов, таких как мультиформная глиобластома, глиомы низкой степени злокачественности имеют более низкую смертность. Однако, после первичного лечения ГНСЗ наблюдается около 40% случаев повторного образования опухолей. В данной работе с использованием RNA-seq данных из базы данных The Cancer Genome Atlas (TCGA) был проведен поиск генов, ответственных за агрессивный фенотип опухолей. Было обнаружено 85 генов, нарушение в уровне экспрессии которых ассоциировано с появлением новых опухолей после первичного лечения.

 
Ключевые слова: глиома низкой степени злокачественности (ГНСЗ), глиома, технология RNA-seq, агрессивность, TCGA. 
 

 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2014;9(2):527-533
doi: 10.17537/2014.9.527
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2021