Русская версия English version   
Том 3   Выпуск 1   Год 2008
Поиск регулярных последовательностей в промоторах из геномов различных групп организмов с использованием критерия серий

Шеленков А.А., Коротков Е.В.

Центр «Биоинженерия» Российской академии наук, Москва, 117312, Россия

Аннотация. В статье вводится понятие «регулярность» для описания структурных свойств последовательностей ДНК, расширяющее понятие скрытой периодичности. Предложен метод обнаружения регулярности с использованием критерия серий. Проведенный поиск регулярных последовательностей в эукариотических промоторах показал, что более 60% из них обладают регулярностью на статистически значимом уровне. Обсуждаются возможные биологические функции регулярности и возможность использования данной характеристики для аннотации промоторов.

Ключевые слова:  регулярностьпромоторыпоследовательности ДНК.
 

 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2008;3(1):1-15
doi: 10.17537/2008.3.1
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2021