Филогения и кросс-регуляция факторов транскрипции YjjM и LeuO, которые транслируются в виде нескольких форм белка у Escherichia coli

Математическая биология и биоинформатика. 2023;18(1):1-14.

doi: 10.17537/2023.18.1.

• Suppl. Fig. 1. Филогенетическое дерево белка YjjM на основе аминокислотных последовательностей YjjM у штаммов Escherichia coli и соответствующего множественного выравнивания. Дерево получено с использованием алгоритма максимального правдоподобия, укоренено вручную с использованием последовательности белка YjjM Kluyvera intermedia str. N2-1 в качестве аутгруппы. Для выравнивания использовалась цветовая схема Clustal X
• Suppl. Fig. 2. Филогенетическое дерево белка LeuO на основе аминокислотных последовательностей LeuO у штаммов Escherichia coli и соответствующего множественного выравнивания. Дерево получено с использованием алгоритма максимального правдоподобия, укоренено вручную с использованием последовательности белка LeuO Kluyvera intermedia str. N2-1 в качестве аутгруппы. Для выравнивания использовалась цветовая схема Clustal X.