Русская версия English version   
Том 9   Выпуск 2   Год 2014
Дерябина А.С., Родригес Э., Гонсалес Э., Дерябин М.С., Эррера X.Н., Санчес К., Полтев В.И.

Молекулярные механизмы биологического действия кофеина. Компьютерное моделирование конкуренции с аденозином за места связывания с рецепторами

Математическая биология и биоинформатика. 2014;9(2):373-385.

doi: 10.17537/2014.9.373.

Список литературы

  1. Brice CF, Smith AP. Int. J. Food Sci. Nutr. 2002;53:55-64.
  2. Frary CD, Johnson RK, Wang MQ. J. Am. Diet. Assoc. 2005;105:110-113. doi: 10.1016/j.jada.2004.10.027.
  3. Brauer LH, Buican B, De Wit H. Behav. Pharmacol. 2002;5:111-118.
  4. Weinberg BA, Bealer BK. The Caffeine Advantage: How to Sharpen Your Mind, Improve Your Physical Performance, and Achieve Your Goals - the Healthy Way. New York: The Free Press; 2002. 256 p.
  5. Ogawa N, Ueki H. Psychiatry Clin. Neurosci. 2007;61:263-268. doi: 10.1111/j.1440-1819.2007.01652.x.
  6. Nurminen ML, Niittynen L, Korpela R, Vapaatalo H. Eur. J. Clin. Nutr. 1999;53:831-839. doi: 10.1038/sj.ejcn.1600899.
  7. Fredholm B, Battig K, Holmen J, Nehlig A, Zvartau E. Pharmacol. Rev. 1999;51:83-133.
  8. Fisone GG, Borgkvist A, Usiello A. Cell. Mol. Life Sci. 2004;61:857-872. doi: 10.1007/s00018-003-3269-3.
  9. Linden J. FASEB J. 1991;5:2668-2676.
  10. Rivkees SA, Barbhaiya H, IJzerman AP. J. Biol. Chem. 1999;274:3617-3621. doi: 10.1074/jbc.274.6.3617.
  11. Fredholm BB, IJzerman AP, Jacobson KA, Klotz KN, Linden J. Pharmacol. Rev. 2001;53:527-552.
  12. Elmenhorst D, Meyer PT, Matusch A, Winz OH, Bauer A. J. Nucl. Med. 2012;53:1723-1729. doi: 10.2967/jnumed.112.105114.
  13. Buscariollo DL, Breuer GA, Wendler CC, Rivkees SA. PLOS ONE. 2011. V. 6. doi: 10.1371/journal.pone.0028296.
  14. Jaakola V-P, Griffith MT, Hanson MA, Cherezov V, Chien EYT, Lane JR, IJzerman AP, Stevens RC. Science. 2008;322:1211-1217. doi: 10.1126/science.1164772.
  15. Poltev V, Rodríguez E, Grokhlina T, Deriabina A, Gonzalez E. Int. J. Quant. Chem. 2010;110:681-688. doi: 10.1002/qua.22106.
  16. Poltev VI, Rodríguez E, Grokhlina T, Teplukhin A, Deriabina A, Gonzalez E. In: Proceedings of the International Conference on Applied Computer Science. Malta; 2010. P. 51-55.
  17. Liu Y, Burger SK, Ayers PW, Esteban Vöhringer-Martinez E. J. Phys. Chem. B. 2011;115:13880-13890. doi: 10.1021/jp2022049.
  18. Lebon G, Warne T, Patricia C, Edwards PC, Kirstie Bennett K, Langmead CJ, Leslie AGW, Tate CG. Nature. 2011;474:521-525. doi: 10.1038/nature10136.
  19. Xu F, Wu H, Katritch V, Han GW, Jacobson KA, Gao Z-G, Cherezov V, Stevens RC. Science. 2011;332:322-327. doi: 10.1126/science.1202793.
  20. Doré AS, Robertson N, Errey JC, Ng I, Hollenstein K, Tehan B, Hurrell E, Bennett K, Congreve M, Magnani F, Tate CG, Weir M, Marshall FH. Structure. 2011;19:1283-1293. doi: 10.1016/j.str.2011.06.014.
  21. Lee JY, Lyman E. Bioph. J. 2012;102:2114-2120. doi: 10.1016/j.bpj.2012.03.061.
  22. Cornell WD, Cieplak P, Gould CI, Merz KM Jr, Ferguson DM, Spellmeyer DC, Fox T, Caldwell JW, Kollman PA. J. Am. Chem. Soc. 1995;117:5179-5197. doi: 10.1021/ja00124a002.
  23. Gaussian 09, Revision D.01. 2013. http://www.gaussian.com/g_tech/rel_notes.pdf (accessed 25 September 2014).
  24. Klooster WT, Ruble JR, Craven BM, Mcmullan RK. Acta Cryst. 1991;B47:376-383. doi: 10.1107/S0108768190012903.
  25. Kraut J, Jensen LH. Acta Cryst. 1963;16:79-88. doi: 10.1107/S0365110X63000207.
  26. Neidle S, Kuhlbrandt W, Achari A. Acta Cryst. 1976;B32:1850-1855. doi: 10.1107/S0567740876006511.

 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2014;9(2):373-385
doi: 10.17537/2014.9.373
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2024