О движении кинка ДНК под действием постоянного торсионного момента
Якушевич Л.В., Балашова В.Н., Закирьянов Ф.К.
Институт биофизики клетки РАН, Пущино, Московская область, Россия
Башкирский государственный университет, Уфа, Россия
Аннотация. Влияние торсионного момента на движение кинка ДНК исследуется методами математического моделирования. Найдены временные зависимости координаты, скорости, размера и энергии кинка при разных значениях параметров внешнего торсионного момента. Показано, что изменяя эти параметры, включая и выключая внешнее воздействие, можно регулировать скорость и направление движения кинка. Приводится оценка значения торсионного момента, необходимого для движения кинка (открытого состояния) со скоростью, сравнимой со скоростью транскрипции.
Ключевые слова: динамика ДНК, угловые колебания азотистых оснований, торсионный момент, уравнение синус-Гордона, кинк.