Разработка математических методов и программных средств выявления функциональных сайтов белков
Шутова И.В., Голубович В.П.
Институт биоорганической химии НАН Беларуси, Минск
shutova2001@mail.ru
Аннотация. Разработан программный комплекс, предназначенный для анализа структуры поверхностей белков с целью выявления функциональных сайтов связывания белков. Комплекс позволяет осуществлять построение поверхностей белков, поиск структурных особенностей построенных поверхностей (карманов, каналов и полостей) и исследование найденных структурных особенностей. С помощью разработанного комплекса определен один из функциональных сайтов гранулоцитарного колониестимулирующего фактора человека и спрогнозирован его низкомолекулярный пептидный функциональный аналог.
Ключевые слова: функциональный сайт белка, поверхность белка, структурные особенности поверхности белка, карманы, каналы, полости.
Идентификационный номер статьи 0421000049012.